RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SFR1Q86XK3 245 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM178BQ8IXR5 827 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYCT1Q8N699 235 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RETREG2Q8NC44 543 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPATA20Q8TB22 786 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATP8B4Q8TF62 1192 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 AFG1LQ8WV93 481 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TCP11Q8WWU5 503 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NLRP7Q8WX94 980 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIFAP3Q92845 792 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HVCN1Q96D96 273 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNAJC19Q96DA6 116 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CEP170P1Q96L14 293 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IFT74Q96LB3 600 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TSG101Q99816 390 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RUSC1Q9BVN2 902 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KDM4CQ9H3R0 1056 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PARVGQ9HBI0 331 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EVA1BQ9NVM1 165 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CTNND2Q9UQB3 1225 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa3.7□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PCNTO95613 3336 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CENPFP49454 3210 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CEP350Q5VT06 3117 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A087WWV3 80 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KRBA1A5PL33 1030 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM150BA6NC51 233 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A6NJR5 290 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC169A6NNP5 214 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KBTBD13C9JR72 458 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 H3BRB1 525 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IKBKBO14920 756 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAGEB2O15479 319 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ADCY6O43306 1168 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF862O60290 1169 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GCNT3O95395 438 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 F2P00734 622 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IGHA2P01877 340 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 INHAP05111 366 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TPM3P06753 285 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TPM2P07951 284 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYL3P08590 195 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MARK3P27448 753 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMOD1P28289 359 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF131P52739 623 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPEPPSP55786 919 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GJA9P57773 515 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RTP1P59025 263 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHMP4BP1P59074 171 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LRRC63Q05C16 580 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPAG1Q07617 926 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 STRN3Q13033 797 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PPFIA1Q13136 1202 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GIT2Q14161 759 aa3.69□□□□□ -1.82
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TFDP1Q14186 410 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms