RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIM3Q86V86 326 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT16Q8N428 558 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPF3Q92784 378 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP2A3Q93084 1043 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00167Q96N53 147 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAMKK2Q96RR4 588 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 AIFM2Q9BRQ8 373 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL23AQ9NPF7 189 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASS4Q9NQ75 786 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 REV1Q9UBZ9 1251 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 POU2F3Q9UKI9 436 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 PADI4Q9UM07 663 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGRNO00468 2067 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JNJ9 132 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GUV1 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 AURKAO14965 403 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHOXO15266 292 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO1BO43795 1136 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJA2O60884 412 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCAR3O75815 825 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAG1P15918 1043 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 FPR2P25090 351 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADCY8P40145 1251 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPHS1P49903 392 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORC1Q13415 861 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTBK2Q6IQ55 1244 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1211LQ6NV74 962 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 NHLRC1Q6VVB1 395 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTOP2Q7RTS6 562 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM48Q8IWZ4 208 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGFRL1Q8N441 504 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52N2Q8NGI0 321 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL8AQ96BM9 186 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTRCQ99895 268 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCD2LQ9BRP1 358 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 KDM4CQ9H3R0 1056 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBCCD1Q9NVR7 557 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q9UFV3 132 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPT3Q9UH03 358 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMTF1Q9Y222 760 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC3P53804 2025 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN5AQ14524 2016 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZG16O60844 167 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FAHP16930 419 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPR3P17342 541 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB25P24278 435 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTT1P30711 240 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVFC1-1P60608 527 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PROSER3Q2NL68 480 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE13Q4V321 117 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF484Q5JVG2 852 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM200BQ69YZ2 307 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4F22Q6NT55 531 aa-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD53Q8N9V6 530 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX27Q96L92 541 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX101Q9BY14 249 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMOC1Q9H4F8 434 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 VRTNQ9H8Y1 702 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RMI1Q9H9A7 625 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDGFCQ9NRA1 345 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD5Q9NXV2 234 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTG4Q9NY30 223 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERGEFQ9UGK8 458 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCAN3Q9UKA8 241 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP-0.25□□□□□ -2.45
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