RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 PEX3P56589 373 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ODR4Q5SWX8 454 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 UNC13DQ70J99 1090 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NLRP4Q96MN2 994 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 GINS2Q9Y248 185 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CCDC169A6NNP5 214 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CHRNA1P02708 482 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 GAP43P17677 238 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PRCPP42785 496 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NPTX2P47972 431 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 GPC3P51654 580 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 BFSP2Q13515 415 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TFDP1Q14186 410 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PPP2R5AQ15172 486 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 KIZQ2M2Z5 673 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM139Q8IV31 216 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 RNF149Q8NC42 400 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CAGE1Q8TC20 777 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PANX2Q96RD6 677 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 A0A087WZ62 844 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 M0QZ92 97 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 PSMA7O14818 248 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ZSCAN12O43309 604 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CAND2O75155 1236 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CTSHP09668 335 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NAMPTP43490 491 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 SMTNP53814 917 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 COASYQ13057 564 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CAPSQ13938 189 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 SYCP1Q15431 976 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 SFR1Q86XK3 245 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TC2NQ8N9U0 490 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 KIF18AQ8NI77 898 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NLRP7Q8WX94 980 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 HPS3Q969F9 1004 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 HIPK3Q9H422 1215 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 TBX21Q9UL17 535 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 GDAQ9Y2T3 454 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-204ENST00000409441 ARID2Q68CP9 1835 aa14.71□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 POU5F1BQ06416 359 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 RBL2Q08999 1139 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TRIM14Q14142 442 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FAM26DQ5JW98 314 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF410Q86VK4 478 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 DEPTORQ8TB45 409 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CCDC51Q96ER9 411 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SCLT1Q96NL6 688 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 THAP9Q9H5L6 903 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EXOC1Q9NV70 894 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EVPLQ92817 2033 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 KCNJ18B7U540 433 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PITPNM1O00562 1244 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 KIAA0355O15063 1070 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SLC16A4O15374 487 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TEX33O43247 280 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TPM1P09493 284 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms