RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409109.5

NLRX1-202, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 4,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-202ENST00000409109 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 CFAP157Q5JU67 520 aa16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 IFNB1P01574 187 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 TRAF1Q13077 416 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PPP2R5EQ16537 467 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PNMA3Q9UL41 463 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 UCHL3P15374 230 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RWDD2BP57060 319 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PPP4CP60510 307 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 JAMLQ86YT9 394 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 DYDC2Q96IM9 177 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ERP44Q9BS26 406 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ZFATQ9P243 1243 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 NAGPAQ9UK23 515 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 ZBED4O75132 1171 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 CENPPQ6IPU0 288 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.78■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RCN2Q14257 317 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 NLRX1Q86UT6 975 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RASA4BC9J798 803 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RASA4O43374 803 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 GAS8O95995 478 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 CA4P22748 312 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 XRCC4Q13426 336 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SGO2Q562F6 1265 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RAD54LQ92698 747 aa16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NLRX1-202ENST00000409109 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ECEL1O95672 775 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 FERP16591 822 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TM4SF1P30408 202 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 CD302Q8IX05 232 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 C18orf8Q96DM3 657 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TMEM237Q96Q45 408 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 HAO1Q9UJM8 370 aa16.77■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 CCT6BQ92526 530 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 SMC6Q96SB8 1091 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 KLC1Q07866 573 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 CACNA1FO60840 1977 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ABCC6O95255 1503 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 A0A0G2JND7 137 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 AGTP01019 485 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 SKIP12755 728 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 KYNUQ16719 465 aa16.76■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ATF2P15336 505 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 LMNB1P20700 586 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 KCNMA1Q12791 1236 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 MREGQ8N565 214 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 KRT16P08779 473 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TRIM49P0CI25 452 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 TRIM49CP0CI26 452 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 STRN3Q13033 797 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 DNAJC3Q13217 504 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.75■□□□□ 0.27
NLRX1-202ENST00000409109 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms