RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ISCUQ9H1K1 167 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 COX16Q9P0S2 106 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ARP10275 920 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT17Q04695 432 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SEZ6Q53EL9 994 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FYB2Q5VWT5 728 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RFX8Q6ZV50 586 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 STMN2Q93045 179 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 IWS1Q96ST2 819 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 STK33Q9BYT3 514 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM206Q9H813 350 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ESYT2A0FGR8 921 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TLR2O60603 784 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RCN2Q14257 317 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RASA3Q14644 834 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NIM1KQ8IY84 436 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC15Q8TF66 581 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 KAT5Q92993 513 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RILPQ96NA2 401 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MTMR9Q96QG7 549 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NPR1P16066 1061 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RAPGEF5Q92565 580 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SMC6Q96SB8 1091 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC160A6NGH7 325 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PIK3R2O00459 728 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 27.3
ANKRD42-202ENST00000393389 CHUKO15111 745 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SGPL1O95470 568 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM107AO95990 144 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SHMT1P34896 483 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 GCKP35557 465 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLMAPQ14BN4 828 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CDO1Q16878 200 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ERP44Q9BS26 406 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH10P35580 1976 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ADCY2Q08462 1091 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CNKSR1Q969H4 720 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 BAG2O95816 211 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FLT3P36888 993 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RHBDL3P58872 404 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NEDD9Q14511 834 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 BARGINQ6ZT62 677 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ATRNO75882 1429 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A0G2JND7 137 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 H7C0C1 242 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms