RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 VPS52Q8N1B4 723 aa18.49■□□□□ 0.55
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PTPRK-208ENST00000392449 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 ARL5CA6NH57 179 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 NRP1O14786 923 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 SCNN1GP51170 649 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRK-208ENST00000392449 ZXDAP98168 799 aa18.42■□□□□ 0.54
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