RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 ORC4O43929 436 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CDH16O75309 829 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 VAMP4O75379 141 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PRDM1O75626 825 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KLHL2O95198 593 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TNFAIP8O95379 198 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CHEK2O96017 543 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KITP10721 976 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GYS1P13807 737 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CD19P15391 556 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FOSL2P15408 326 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 STAT4Q14765 748 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KIF19Q2TAC6 998 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TRIM69Q86WT6 500 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 COPG2Q9UBF2 871 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PNMA2Q9UL42 364 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PALD1Q9ULE6 856 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A0A087WWV3 80 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PEX5P50542 639 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCZ1BP86790 482 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SETDB2Q96T68 719 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 POLD4Q9HCU8 107 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CENPXA8MT69 81 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PFDN6O15212 129 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 BNC1Q01954 994 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GIPC3Q8TF64 312 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 VPS50Q96JG6 964 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GLI2P10070 1586 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KIAA0232Q92628 1395 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MED26O95402 600 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 S100A6P06703 90 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MMP10P09238 476 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC166P0CW27 439 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 APLP1P51693 650 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ARL4CP56559 192 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DMC1Q14565 340 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DNM3Q9UQ16 869 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RGS5O15539 181 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LPXNO60711 386 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PALMO75781 387 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CHRNA3P32297 505 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TCIRG1Q13488 830 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC142Q17RM4 750 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 WDR93Q6P2C0 686 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 C16orf89Q6UX73 402 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CLIC6Q96NY7 704 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZBTB18Q99592 522 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NPHS2Q9NP85 383 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RRN3Q9NYV6 651 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 UBE4BO95155 1302 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms