RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LPPQ93052 612 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 H7C4K7 107 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CLIC2O15247 247 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CD58P19256 250 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GJC1P36383 396 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 EPHB3P54753 998 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IL31RAQ8NI17 732 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KSR1Q8IVT5 923 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 DOCK2Q92608 1830 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 PRR23AA6NEV1 266 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVL5 298 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CARNS1A5YM72 827 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MYADML2A6NDP7 307 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PTGS1P23219 599 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PBX3P40426 434 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3CAP42336 1068 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF394Q53GI3 561 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF280DQ6N043 979 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 POF1BQ8WVV4 589 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GJD2Q9UKL4 321 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 A8MXQ7 604 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MSH4O15457 936 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATP9AO75110 1047 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PDGFRBP09619 1106 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC192P0DO97 292 aa4.82□□□□□ -1.64
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