RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MAPK7Q13164 816 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 C18orf8Q96DM3 657 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 SPARCL1Q14515 664 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TRADDQ15628 312 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ELF1P32519 619 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MORC4Q8TE76 937 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 PLS3P13797 630 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 RINT1Q6NUQ1 792 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SCTRP47872 440 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA21Q7Z572 469 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM120BA0PK00 339 aa16.61■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 H0YCG3 227 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MSH2P43246 934 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 EPHA7Q15375 998 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 KYNUQ16719 465 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 BBS9Q3SYG4 887 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CASC4Q6P4E1 433 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf72Q96LT7 481 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 F8VZ95 297 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 JDP2Q8WYK2 163 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.61■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FAM81BQ96LP2 452 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DNAI2Q9GZS0 605 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DCCP43146 1447 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DENND3A2RUS2 1198 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SLC26A4O43511 780 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CD58P19256 250 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SCP2P22307 547 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PLCB4Q15147 1175 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 CENPUQ71F23 418 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 IQCKQ8N0W5 287 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 C3orf20Q8ND61 904 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 43.2
PTPRU-201ENST00000345512 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MTMR1Q13613 665 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 RASA3Q14644 834 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FAM167BQ9BTA0 163 aa16.6■□□□□ 0.25
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