RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TGFB1I1O43294 461 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ADAM9Q13443 819 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NFIL3Q16649 462 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRPV1Q8NER1 839 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMEM206Q9H813 350 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 Q9Y3F1 56 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 COQ9O75208 318 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NR3C1P04150 777 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CYBAP13498 195 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PTPN21Q16825 1174 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HS1BP3Q53T59 392 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TAF4BQ92750 862 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HVCN1Q96D96 273 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 COL1A2P08123 1366 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 A6NJR5 290 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 N4BP3O15049 544 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CETN3O15182 167 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CLIC2O15247 247 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GNA14O95837 355 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GLRA2P23416 452 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NR2F2P24468 414 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FLT3P36888 993 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PMM1Q92871 262 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KLHL33A6NCF5 533 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KIF5CO60282 957 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 AKR1A1P14550 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PBX1P40424 430 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CPT1AP50416 773 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN26Q16670 478 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MIIPQ5JXC2 388 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TCP11Q8WWU5 503 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GBP3Q9H0R5 595 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TBX20Q9UMR3 447 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ITM2BQ9Y287 266 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DENND3A2RUS2 1198 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LGALS16A8MUM7 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 H0YCG3 227 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 H3BRB1 525 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 INSRRP14616 1297 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NAMPTP43490 491 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 UBXN1Q04323 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IER5Q5VY09 327 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GPR25O00155 361 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C22orf31O95567 290 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HOXD10P28358 340 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IGBP1P78318 339 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIM32Q13049 653 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DRP2Q13474 957 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MAN2A1Q16706 1144 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 VWA3BQ502W6 1294 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SRRDQ9UH36 339 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CAPSQ13938 189 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ARMC3Q5W041 872 aa6.6□□□□□ -1.35
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