RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 KANK3Q6NY19 840 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PAGE5Q96GU1 130 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 GBP4Q96PP9 640 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PANK4Q9NVE7 773 aa29.48■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 C9IYK1 514 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 MAPTP10636 758 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 SKIP12755 728 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 FAM160A1Q05DH4 1040 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 NOTUMQ6P988 496 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 HERC6Q8IVU3 1022 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 CNNM3Q8NE01 707 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 KCNN1Q92952 543 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC51Q96ER9 411 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ZBED2Q9BTP6 218 aa29.47■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 GBF1Q92538 1859 aa29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0U1RQF3 1178 aa29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 FRMD3A2A2Y4 597 aa29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 HAUS6Q7Z4H7 955 aa29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa29.46■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GUA9 196 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 LIG1P18858 919 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 RAB27AP51159 221 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2HP62256 183 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ASIC1P78348 528 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 STRN3Q13033 797 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 NPAS4Q8IUM7 802 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 ENGASEQ8NFI3 743 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 LRFN2Q9ULH4 789 aa29.45■■■□□ 2.31
CRIP1-201ENST00000330233 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 UPP2O95045 317 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GJB5O95377 273 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 EOMESO95936 686 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 SFR1Q86XK3 245 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 CPB2Q96IY4 423 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 OLFML3Q9NRN5 406 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29.45■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 K7ENM7 598 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALT5O43286 388 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF720Q7Z2F6 126 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 CRIPAKQ8N1N5 446 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TIGD1Q96MW7 591 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 RAD9AQ99638 391 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM161AQ9NX61 479 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 MSRAQ9UJ68 235 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 INSL6Q9Y581 213 aa29.44■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 N4BP3O15049 544 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TLL1O43897 1013 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF623O75123 536 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2BQ00403 316 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 RAB30Q15771 203 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 UNC13DQ70J99 1090 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 FIZ1Q96SL8 496 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 BLZF1Q9H2G9 400 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 FAM105AQ9NUU6 356 aa29.43■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 NMT1P30419 496 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 CUL4BQ13620 913 aa29.42■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 FAM117BQ6P1L5 589 aa29.42■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TAS1R3Q7RTX0 852 aa29.42■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 COASYQ13057 564 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TBX20Q9UMR3 447 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa29.41■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 RABGGTBP53611 331 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ALCAMQ13740 583 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 UBXN11Q5T124 520 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ATF7IP2Q5U623 682 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 HVCN1Q96D96 273 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PGBD4Q96DM1 585 aa29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms