RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MXI1P50539 228 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RTP1P59025 263 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 KIF22Q14807 665 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 XKR3Q5GH77 459 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RNF181Q9P0P0 153 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RNF14Q9UBS8 474 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 GALCP54803 685 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MTERF2Q49AM1 385 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ELP3Q9H9T3 547 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 FBXO40Q9UH90 709 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 IRF6O14896 467 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 PMM2O15305 246 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ATP4AP20648 1035 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ATG7O95352 703 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CASP8Q14790 479 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 OTUD5Q96G74 571 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 ZNF302Q9NR11 478 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 IFT74Q96LB3 600 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 TNFAIP3P21580 790 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 RPS6KA1Q15418 735 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 FBXL18Q96ME1 805 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 EMC2Q15006 297 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 MAP9Q49MG5 647 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 PALB2Q86YC2 1186 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 KAT5Q92993 513 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 HINFPQ9BQA5 517 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 SPON1Q9HCB6 807 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 215.8
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 USP20Q9Y2K6 914 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX18-201ENST00000326277 KIF4AO95239 1232 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 MYBL2P10244 700 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 PPATQ06203 517 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 SEMA4DQ92854 862 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 OATP04181 439 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 TAF4BQ92750 862 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 AGPAT1Q99943 283 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 TMEM253P0C7T8 217 aa24.75■■□□□ 1.55
SNX18-201ENST00000326277 EDNRBP24530 442 aa24.75■■□□□ 1.55
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