RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CPA4Q9UI42 421 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 PASKQ96RG2 1323 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM150BA6NC51 233 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP6O43182 974 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GH1P01241 217 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CASP14P31944 242 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ6P48051 423 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX3P56589 373 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CCZ1BP86790 482 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 NNTQ13423 1086 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R5AQ15172 486 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MTERF2Q49AM1 385 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MIIPQ5JXC2 388 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 RETREG3Q86VR2 466 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TC2NQ8N9U0 490 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR20Q99678 358 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TINF2Q9BSI4 451 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMX1Q9H3N1 280 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOFQ9HC10 1997 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP14Q460N5 1801 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIC2O15247 247 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFB1I1O43294 461 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 LGR5O75473 907 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP4AP20648 1035 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT9P35527 623 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 NPTX2P47972 431 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNA1Q09470 495 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SYCP1Q15431 976 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN21Q16825 1174 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP135Q66GS9 1140 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf99Q6UX52 265 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MAML3Q96JK9 1138 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRFP10586 1907 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A4O15374 487 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOC3O60645 756 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MFAP3LO75121 409 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PPFIA4O75335 1185 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ARIH2O95376 493 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ADH1CP00326 375 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TM4SF4P48230 202 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 NCKAP1LP55160 1127 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP2K5Q13163 448 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF5Q13568 498 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ACVR2BQ13705 512 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC2Q15006 297 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 FIGNQ5HY92 759 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 PCYT2Q99447 389 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 KCND1Q9NSA2 647 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 DMAC2Q9NW81 257 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX20Q9UMR3 447 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PQJ5 194 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 SOBPA7XYQ1 873 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN12O43309 604 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 HBP1O60381 514 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP3O75969 853 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TOMM70O94826 608 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 GYPCP04921 128 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMP2P16035 220 aa11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms