RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 FBXL18Q96ME1 805 aa29.18■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 CDC23Q9UJX2 597 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 V9GYY5 206 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 GARTP22102 1010 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 PPP3CAQ08209 521 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 CETN1Q12798 172 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 TTLL4Q14679 1199 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.17■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 DUSP10Q9Y6W6 482 aa29.17■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 TXNP10599 105 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 GLG1Q92896 1179 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 SAAL1Q96ER3 474 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA33Q96N06 139 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 STK33Q9BYT3 514 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 MAFO75444 373 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 ANXA13P27216 316 aa29.16■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 BICD1Q96G01 975 aa29.16■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 MACROD2A1Z1Q3 448 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 STRNO43815 780 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 FERP16591 822 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 PTK2Q05397 1052 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 DEPTORQ8TB45 409 aa29.15■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 GCLMP48507 274 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 STRN3Q13033 797 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 EPC2Q52LR7 807 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
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HOXD8-201ENST00000313173 A0A087X0T9 212 aa29.14■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 F8VZ95 297 aa29.14■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 TRIM58Q8NG06 486 aa29.12■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 USP20Q9Y2K6 914 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 STYXL1Q9Y6J8 313 aa29.12■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.11■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 CAPSQ13938 189 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf76Q5T2E6 689 aa29.1■■■□□ 2.25
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HOXD8-201ENST00000313173 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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