RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 FANCCQ00597 558 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 POU5F1BQ06416 359 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 DPYDQ12882 1025 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ODR4Q5SWX8 454 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FAM228AQ86W67 206 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC8AQ8IWT6 810 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 DEPTORQ8TB45 409 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 APBB2Q92870 758 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 IFNKQ9P0W0 207 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PADI3Q9ULW8 664 aa13.12□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SFI1A8K8P3 1242 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 GPR182O15218 404 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FGBP02675 491 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 MYL1P05976 194 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ACTN1P12814 892 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PLS3P13797 630 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 AFMP43652 599 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF131P52739 623 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PEX3P56589 373 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM240Q5SV17 173 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF365Q70YC5 407 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM9Q9C026 710 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PARVGQ9HBI0 331 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC169A6NNP5 214 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 IDEP14735 1019 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FGFR4P22455 802 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 BMP8BP34820 402 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 NPTX2P47972 431 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ASIC1P78348 528 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 TCTN1Q2MV58 587 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 MYCT1Q8N699 235 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 RMND1Q9NWS8 449 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PTPRSQ13332 1948 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 BAIAP3O94812 1187 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SERPINC1P01008 464 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SMTNP53814 917 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 UBASH3AP57075 661 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 IKBKEQ14164 716 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FANCLQ9NW38 375 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.1□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ZBBXA8MT70 800 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SLC16A4O15374 487 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 NRDCO43847 1150 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 EFCAB14O75071 495 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ERLIN2O94905 339 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 GAP43P17677 238 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CASP1P29466 404 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 EFNA5P52803 228 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 SFR1Q86XK3 245 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 HERVK_113Q902F9 699 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms