RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 NAMPTP43490 491 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL4Q14679 1199 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 SLC18A3Q16572 532 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ENC1O14682 589 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ELF2Q15723 593 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 DEPTORQ8TB45 409 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 SCFD2Q8WU76 684 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 FAM167AQ96KS9 214 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL18Q96ME1 805 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 F8VZ95 297 aa24.74■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 GPR88Q9GZN0 384 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CDC23Q9UJX2 597 aa24.74■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.74■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 GFPT2O94808 682 aa24.73■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 PRKCIP41743 596 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 STAT1P42224 750 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 LIG4P49917 911 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.73■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 ABCD1P33897 745 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 CAPSQ13938 189 aa24.73■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 EPC2Q52LR7 807 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 GPR142Q7Z601 462 aa24.73■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 MXI1P50539 228 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CETN1Q12798 172 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.72■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 MOCS3O95396 460 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 SOX5P35711 763 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 AMPD2Q01433 879 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 EVI5O60447 810 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP1Q07960 439 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CYP24A1Q07973 514 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 KCNN1Q92952 543 aa24.71■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 FERP16591 822 aa24.7■■□□□ 1.55
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VSTM4-201ENST00000298454 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.7■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.7■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 HUNKP57058 714 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 DPP9Q86TI2 863 aa24.69■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 TMC2Q8TDI7 906 aa24.69■■□□□ 1.54
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