RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297615.9

TTC39B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TTC39B, Length 3,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39B-201ENST00000297615 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 VWA5AO00534 786 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF862O60290 1169 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 OPA1O60313 960 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ATP2C2O75185 946 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 KIF4AO95239 1232 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FLT3P36888 993 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PTGER2P43116 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PAK2Q13177 524 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 BIRC3Q13489 604 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ANO5Q75V66 913 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 IQCDQ96DY2 449 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 MRIQ9BWK5 157 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PLAAQ9Y263 795 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ADM5C9JUS6 153 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 NDUFAB1O14561 156 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TBX3O15119 743 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TTI1O43156 1089 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FGGP02679 453 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 KCNJ1P48048 391 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ERVK-9P63128 1117 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TNNC1P63316 161 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SNX1Q13596 522 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 USP38Q8NB14 1042 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SEMA4DQ92854 862 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TMEM51Q9NW97 253 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 MYH11P35749 1972 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TLDC2A0PJX2 215 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 VAMP7P51809 220 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 IGBP1P78318 339 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SP2Q02086 613 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 BFSP1Q12934 665 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 OTUD5Q96G74 571 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF233A6NK53 670 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TNNI1P19237 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ORC1Q13415 861 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 FAM160B2Q86V87 743 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PPFIA1Q13136 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PPP2R5CQ13362 524 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 DRP2Q13474 957 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TREML2Q5T2D2 321 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 KRT35Q92764 455 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 F8VZ95 297 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 MMEP08473 750 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CNGA1P29973 690 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 NPTX2P47972 431 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 WNT7BP56706 349 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 EMBQ6PCB8 327 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC25Q86WR0 208 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 USTQ9Y2C2 406 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PPFIA4O75335 1185 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ADCY1Q08828 1119 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CHADLQ6NUI6 762 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PXMP2Q9NR77 195 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PIK3CDO00329 1044 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 EBAG9O00559 213 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PRLRP16471 622 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 ADSSP30520 456 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 SOX5P35711 763 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC39B-201ENST00000297615 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms