RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.97■■□□□ 1.75
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TRIM54-201ENST00000296098 TNNC1P63316 161 aa25.97■■□□□ 1.75
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TRIM54-201ENST00000296098 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
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TRIM54-201ENST00000296098 BSNDQ8WZ55 320 aa25.96■■□□□ 1.75
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TRIM54-201ENST00000296098 GDF3Q9NR23 364 aa25.95■■□□□ 1.74
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TRIM54-201ENST00000296098 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.94■■□□□ 1.74
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TRIM54-201ENST00000296098 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.94■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.94■■□□□ 1.74
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TRIM54-201ENST00000296098 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.92■■□□□ 1.74
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TRIM54-201ENST00000296098 RNF40O75150 1001 aa25.92■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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TRIM54-201ENST00000296098 GGCXP38435 758 aa25.91■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 KRT39Q6A163 491 aa25.91■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.91■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.91■■□□□ 1.74
TRIM54-201ENST00000296098 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.91■■□□□ 1.74
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