RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 ENC1O14682 589 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GFPT2O94808 682 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 DLG4P78352 724 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CETN1Q12798 172 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GJB7Q6PEY0 223 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.39■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.39■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 RFC5P40937 340 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 STAT5BP51692 787 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP3CAQ08209 521 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 LY6KQ17RY6 165 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 EPC2Q52LR7 807 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM167AQ96KS9 214 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 NENFQ9UMX5 172 aa23.38■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ARIH2O95376 493 aa23.37■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 PRLRP16471 622 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GARTP22102 1010 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 TEX35Q5T0J7 233 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 RRAGCQ9HB90 399 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PLXNB2O15031 1838 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 MOCS3O95396 460 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ADRB2P07550 413 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 NAB2Q15742 525 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 NOX5Q96PH1 765 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.37■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE8P0CG41 777 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ARL2P36404 184 aa23.36■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS36Q86VN1 386 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TMC2Q8TDI7 906 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GPR88Q9GZN0 384 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 AZI2Q9H6S1 392 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.36■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 LGR5O75473 907 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 SPRYD7Q5W111 196 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.35■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 GPR20Q99678 358 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 NAGPAQ9UK23 515 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 STRNO43815 780 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 EVI5O60447 810 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.35■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 MXI1P50539 228 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL4Q14679 1199 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SNX12Q9UMY4 172 aa23.34■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 GCLMP48507 274 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 USP37Q86T82 979 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SCFD2Q8WU76 684 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 INTUQ9ULD6 942 aa23.33■■□□□ 1.33
SNRNP25-201ENST00000293861 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.33■■□□□ 1.33
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