RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 IWS1Q96ST2 819 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 RAB21Q9UL25 225 aa18.27■□□□□ 0.52
PKN3-201ENST00000291906 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MYBL2P10244 700 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 LIG4P49917 911 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CASP8Q14790 479 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SEZ6Q53EL9 994 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.27■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MAFGO15525 162 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ACOT2P49753 483 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 C8orf74Q6P047 294 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 KIFAP3Q92845 792 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ESYT3A0FGR9 886 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 LY6KQ17RY6 165 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SLC9A9Q8IVB4 645 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 GLG1Q92896 1179 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 PFASO15067 1338 aa18.26■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 DGAT1O75907 488 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 NF2P35240 595 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 PRKCIP41743 596 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 NCKAP1LP55160 1127 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TUBB4BP68371 445 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TRIM50Q86XT4 487 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 IFT81Q8WYA0 676 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 KRT12Q99456 494 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 DOCK1Q14185 1865 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CYP26A1O43174 497 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 KRT5P13647 590 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 EMC2Q15006 297 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 NFIL3Q16649 462 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 NAA35Q5VZE5 725 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 LBX2Q6XYB7 198 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 FAM212AQ96EL1 285 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 GGPS1O95749 300 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TNNI1P19237 187 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 DEPTORQ8TB45 409 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SEMA4DQ92854 862 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 L1RE1Q9UN81 338 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.25■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ERICH4A6NGS2 130 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 BIRC3Q13489 604 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 EPC2Q52LR7 807 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 XKR3Q5GH77 459 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TCHPQ9BT92 498 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CCDC172P0C7W6 258 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 STRN3Q13033 797 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 CHST13Q8NET6 341 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SGPL1O95470 568 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 LLGL1Q15334 1064 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 RDM1Q8NG50 284 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 THAP2Q9H0W7 228 aa18.24■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 H3BQF6 201 aa18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 TPCN2Q8NHX9 752 aa18.23■□□□□ 0.51
PKN3-201ENST00000291906 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms