RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261435.10

N4BP2-201, Transcript of NEDD4 binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene N4BP2, Length 9,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2-201ENST00000261435 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RNF181Q9P0P0 153 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 A6NNZ2 444 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 INHBAP08476 426 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 HERVK_113P62684 666 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ORC1Q13415 861 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ZNF699Q32M78 642 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CROCCP2Q86T23 111 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MCUQ8NE86 351 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GRAP2O75791 330 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RPA1P27694 616 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PNMA5Q96PV4 448 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 H3BQF6 201 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 AKAP3O75969 853 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 AKT1S1Q96B36 256 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ACAD9Q9H845 621 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TISP43B9A030 160 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CCDC188H7C350 402 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 BAG2O95816 211 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GABPAQ06546 454 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 NXNQ6DKJ4 435 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 EFCC1Q9HA90 598 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GGA3Q9NZ52 723 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.29□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PRPSAP2O60256 369 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CIB2O75838 187 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GGPS1O95749 300 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 LGSNQ5TDP6 509 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MIS12Q9H081 205 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 KCNJ6P48051 423 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 26.6
N4BP2-201ENST00000261435 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 INTUQ9ULD6 942 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 GNA15P30679 374 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PLS3P13797 630 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 CUL1Q13616 776 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MTRQ99707 1265 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 M0QYV0 167 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 EPHB6O15197 1021 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PHBP35232 272 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MTMR8Q96EF0 704 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SCYL1Q96KG9 808 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SNX25Q9H3E2 840 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 MCF2LO15068 1137 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 FAM151AQ8WW52 585 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SPATA33Q96N06 139 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 SHPRHQ149N8 1683 aa7.28□□□□□ -1.24
N4BP2-201ENST00000261435 ESYT2A0FGR8 921 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms