RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 NEDD9Q14511 834 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 SLMAPQ14BN4 828 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 QPCTQ16769 361 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 PALB2Q86YC2 1186 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KAT5Q92993 513 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 IFT74Q96LB3 600 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 C9orf72Q96LT7 481 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 CARD9Q9H257 536 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 CEP83Q9Y592 693 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 DISP2A7MBM2 1401 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 A0A1B0GUA9 196 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ARP10275 920 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 BRAFP15056 766 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 NPEPPSP55786 919 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 MYO1EQ12965 1108 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 CLUL1Q15846 466 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 AOC3Q16853 763 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 HAUS6Q7Z4H7 955 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 CROCCP2Q86T23 111 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 SP8Q8IXZ3 490 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KIRREL3Q8IZU9 778 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 TMEM206Q9H813 350 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KMT5AQ9NQR1 393 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 NYAP2Q9P242 653 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 ASTN1O14525 1302 aa5.09□□□□□ -1.59
USP44-201ENST00000258499 WDR91A4D1P6 747 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 FAM187AA6NFU0 413 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ATP2A1O14983 1001 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 TBX3O15119 743 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ECE2O60344 883 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 SGPL1O95470 568 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 CALCAP01258 141 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 HSPA6P17066 643 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 PDE6BP35913 854 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 SREBF1P36956 1147 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ATP11AP98196 1134 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 KRT17Q04695 432 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 CCDC6Q16204 474 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 KYNUQ16719 465 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ZNF394Q53GI3 561 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 LIN9Q5TKA1 542 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 WDR78Q5VTH9 848 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 NLRX1Q86UT6 975 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 FBF1Q8TES7 1133 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 SCFD2Q8WU76 684 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ALG3Q92685 438 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 FAM84AQ96KN4 292 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 CEP170P1Q96L14 293 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 DENND3A2RUS2 1198 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 TGFB1I1O43294 461 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 PHF2O75151 1096 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 CD19P15391 556 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 SLC8A1P32418 973 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 LIG4P49917 911 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 ZNF131P52739 623 aa5.08□□□□□ -1.6
USP44-201ENST00000258499 DYNLT1P63172 113 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms