RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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HOXC11-201ENST00000243082 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.08■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 COPB2P35606 906 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CETN1Q12798 172 aa20.08■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 CREG2Q8IUH2 290 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SYT11Q9BT88 431 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TLR10Q9BXR5 811 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 GGPS1O95749 300 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 VPS36Q86VN1 386 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM143Q96AN5 459 aa20.07■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 PORCNQ9H237 461 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 USP20Q9Y2K6 914 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.07■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 PALMO75781 387 aa20.07■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 RAB21Q9UL25 225 aa20.07■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 GLRA2P23416 452 aa20.05■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 KCTD2Q14681 263 aa20.05■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 TMC2Q8TDI7 906 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 KIF22Q14807 665 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC151A5D8V7 595 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 CCDC172P0C7W6 258 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 CYP24A1Q07973 514 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXC11-201ENST00000243082 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 MROH8Q9H579 483 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SCN4AP35499 1836 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 RFC5P40937 340 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 NAMPTP43490 491 aa20.03■□□□□ 0.8
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