RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.17■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 RNF19AQ9NV58 838 aa24.17■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.17■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa24.17■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.16■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 RPA1P27694 616 aa24.16■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 PPM1AP35813 382 aa24.16■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.462e-46■■■■□ 22.3
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NME4-201ENST00000219479 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.15■■□□□ 1.46
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NME4-201ENST00000219479 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.464e-6■■■■□ 23.1
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NME4-201ENST00000219479 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.15■■□□□ 1.46
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NME4-201ENST00000219479 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 LPPQ93052 612 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 TLE6Q9H808 572 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 TLR9Q9NR96 1032 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.15■■□□□ 1.46
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NME4-201ENST00000219479 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 STK24Q9Y6E0 443 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 KMT2EQ8IZD2 1858 aa24.15■■□□□ 1.46
NME4-201ENST00000219479 LAD1O00515 517 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PER2O15055 1255 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ARL2P36404 184 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PTENP60484 403 aa24.14■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 KRT17Q04695 432 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CAPSQ13938 189 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.14■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ZNF623O75123 536 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 MUTP22033 750 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PBX3P40426 434 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 POU5F1BQ06416 359 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 TRIM67Q6ZTA4 783 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 SPG21Q9NZD8 308 aa24.13■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 TMEM221A6NGB7 291 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 M0R296 226 aa24.12■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 AXLP30530 894 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PDIA5Q14554 519 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 DUSP6Q16828 381 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.12■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 URGCPQ8TCY9 931 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.12■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 LZTS1Q9Y250 596 aa24.12■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 TSPAN1O60635 241 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ERVFC1P60507 584 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 ZXDAP98168 799 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PLCB3Q01970 1234 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 KRT79Q5XKE5 535 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PRSS33Q8NF86 280 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CCDC51Q96ER9 411 aa24.11■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.11■■□□□ 1.45
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NME4-201ENST00000219479 CNNM3Q8NE01 707 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 SUSD6Q92537 303 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CPB2Q96IY4 423 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 TCF25Q9BQ70 676 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 GBP3Q9H0R5 595 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 RSAD1Q9HA92 442 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.1■■□□□ 1.45
NME4-201ENST00000219479 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.09■■□□□ 1.45
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