RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204005.13

LTBP4-201, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBP4, Length 5,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-201ENST00000204005 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ESYT3A0FGR9 886 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SLC25A27O95847 323 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TGFB2P61812 414 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 BBS5Q8N3I7 341 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CHST13Q8NET6 341 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PFASO15067 1338 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PODXLO00592 558 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.854e-7■■□□□ 14.4
LTBP4-201ENST00000204005 RNF149Q8NC42 400 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ACER1Q8TDN7 264 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PLS3P13797 630 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GRIN3BO60391 1043 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 HUS1O60921 280 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ICAM1P05362 532 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.855e-7■■□□□ 13.4
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SHPRHQ149N8 1683 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GMCL1Q96IK5 515 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GMNNO75496 209 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ACTN1P12814 892 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 KYAT1Q16773 422 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PASD1Q8IV76 773 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TJP3O95049 919 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 GNA15P30679 374 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PPP2R5CQ13362 524 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MUM1Q2TAK8 710 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.859e-7■□□□□ 10.3
LTBP4-201ENST00000204005 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MTFR1LQ9H019 292 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SNX24Q9Y343 169 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PFDN6O15212 129 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 KLHL29Q96CT2 875 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 UBE4BO95155 1302 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF185O15231 689 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 PRKCBP05771 671 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 RNF139Q8WU17 664 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 SLC37A4O43826 429 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF18P17022 549 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ECE1P42892 770 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 VCX3BQ9H321 246 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZWILCHQ9H900 591 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CIITAP33076 1130 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 RFFLQ8WZ73 363 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TMX2Q9Y320 296 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 CPP00450 1065 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 MYBP10242 640 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 ANXA13P27216 316 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TMED2Q15363 201 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBP4-201ENST00000204005 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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