RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	IST2	P38250	946 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SHG1	P38337	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	GOS1	P38736	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YAL037W	P39728	267 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	CPD1	P53314	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	BUD32	P53323	261 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PLM2	Q04383	521 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YML096W	Q04489	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RKM5	Q12367	367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	DCN1	Q12395	269 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YBR241C	P38142	488 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YBP1	P38315	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SEN34	P39707	275 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YFH7	P43591	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	GTR2	P53290	341 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	IBD2	P53892	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YNL095C	P53932	642 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PRM6	Q04705	352 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YNG1	Q08465	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	POM33	Q12164	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ATG34	Q12292	412 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	HEM2	P05373	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CUP2	P15315	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	POF1	P25576	258 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ACB1	P31787	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PCI8	P40512	444 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YGR201C	P42936	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	LST7	P53237	242 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	DUG3	P53871	357 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NRK1	P53915	240 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	GPI15	P53961	229 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NUP49	Q02199	472 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HER2	Q03557	464 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TRS23	Q03784	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ARO80	Q04052	950 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RAD34	Q06665	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HNT3	Q08702	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SUT2	Q12286	268 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TIP20	P33891	701 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YKL063C	P35725	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YKR073C	P36153	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SUL1	P38359	859 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TDA11	P38854	504 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YCH1	P42937	148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MDV1	P47025	714 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MIC26	P50087	233 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MMS2	P53152	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	JAC1	P53193	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MTM1	P53320	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ECI1	Q05871	280 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MED7	Q08278	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	FCY22	Q12119	530 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TPK3	P05986	398 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MKK1	P32490	508 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ZRT1	P32804	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	APL3	P38065	1025 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PAC2	P39937	518 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MOG1	P47123	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PEX31	P53203	462 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MCH4	Q08268	501 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HEM15	P16622	393 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PMT2	P31382	759 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CUE1	P38428	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PMT6	P42934	759 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NSG2	P53898	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PFA5	Q03289	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SGT1	Q08446	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	DCC1	P25559	380 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HSP30	P25619	332 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	QRI5	P32344	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
HOF1	YMR032W	FAA2	P39518	744 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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