RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642102.1

CASC19-280, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,351 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-280	ENST00000642102	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MTSS1	O43312	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	FAM20B	O75063	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ASL	P04424	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SPIDR	Q14159	915 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	NPEPPS	P55786	919 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	FSTL1	Q12841	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	GC	P02774	474 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64	8e-7	■□□□□ 10.5
CASC19-280	ENST00000642102	GNAT2	P19087	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	OPA1	O60313	960 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	FSBP	O95073	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ITGB1	P05556	798 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	NRP1	O14786	923 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	IKBKB	O14920	756 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	OPHN1	O60890	802 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PROZ	P22891	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	FLT3	P36888	993 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PTPA	Q15257	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	CBX4	O00257	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	RECQL4	O94761	1208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ABHD16A	O95870	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	SLC9A1	P19634	815 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	NR4A1	P22736	598 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ZNF460	Q14592	562 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CASC19-280	ENST00000642102	TRIM24	O15164	1050 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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