RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EPHA7	Q15375	998 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TKFC	Q3LXA3	575 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CDCA5	Q96FF9	252 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DYDC2	Q96IM9	177 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NOD2	Q9HC29	1040 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLITRK3	O94933	977 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MYZAP	P0CAP1	466 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SEC24C	P53992	1094 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PGM5	Q15124	567 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPDL1	Q96EA4	605 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RMDN3	Q96TC7	470 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PXMP2	Q9NR77	195 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		16.6	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DNM1L	O00429	736 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	E2F5	Q15329	346 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC38	Q502W7	563 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TPH2	Q8IWU9	490 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OTOF	Q9HC10	1997 aa		16.59	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GLTPD2	A6NH11	291 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LMNB2	Q03252	620 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PPAT	Q06203	517 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GIT2	Q14161	759 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC41	Q15345	812 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GPR162	Q16538	588 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCT6B	Q92526	530 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ITFG2	Q969R8	447 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC45	Q96CN5	670 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HVCN1	Q96D96	273 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MAF1	Q9H063	256 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ELP3	Q9H9T3	547 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TRPC6	Q9Y210	931 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		16.58	■□□□□ 0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	INHBE	P58166	350 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC63	Q05C16	580 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NEK9	Q8TD19	979 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ACAD9	Q9H845	621 aa		16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LCA5L	O95447	670 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MTMR1	Q13613	665 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MTMR3	Q13615	1198 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TREML2	Q5T2D2	321 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ERO1B	Q86YB8	467 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC42	Q96M95	316 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NACC1	Q96RE7	527 aa		16.57	■□□□□ 0.24

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