RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM105AQ9NUU6 356 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB4Q9UDY4 337 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM150BA6NC51 233 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC11A1P49279 550 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB27AP51159 221 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 XKR3Q5GH77 459 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR149Q86SP6 731 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RHPN2Q8IUC4 686 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIS3P2A8K0S8 358 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CPA1P15085 419 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TDGQ13569 410 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ADSSL1Q8N142 457 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 URGCPQ8TCY9 931 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A5Q92911 643 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 BRF1Q92994 677 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP4Q96MN2 994 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TSGA10IPQ3SY00 556 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZUG5 572 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF410Q86VK4 478 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PGBD4Q96DM1 585 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAIPQ9BWF2 469 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 STK25O00506 426 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 OFD1O75665 1012 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 AOC1P19801 751 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 RFX1P22670 979 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SIX5Q8N196 739 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL5Q96PQ7 755 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A6Q9BXS9 759 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PI15O43692 258 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 RDM1Q8NG50 284 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 VN1R3Q9BXE9 311 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP12Q9UNI6 340 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ID4P47928 161 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 USP11P51784 963 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN4P51793 760 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPT1Q15389 498 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF280BQ86YH2 543 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 KSR1Q8IVT5 923 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC105Q8IYK2 499 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 RTP3Q9BQQ7 232 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK12Q9HB15 430 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 STK39Q9UEW8 545 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO10Q9HD67 2058 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CNPP09543 421 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP5P59047 1200 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TBCKQ8TEA7 893 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO15AQ9UKN7 3530 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD2LO14523 706 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALT3O60512 393 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF623O75123 536 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD10O75832 226 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NPR3P17342 541 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 LETM2Q2VYF4 491 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DTWD2Q8NBA8 298 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNG4Q8TDN1 519 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAN1Q9Y2M0 1017 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-217ENST00000629983 EDIL3O43854 480 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP2KLQ5H9B9 411 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP89Q96ST8 783 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RSAD1Q9HA92 442 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFO75444 373 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
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CAPNS1-217ENST00000629983 TDP2O95551 362 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH2P05091 517 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 URODP06132 367 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 AK2P54819 239 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4FQ68DD2 849 aa30.68■■■□□ 2.5
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CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ERMP1Q7Z2K6 904 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 MAN1C1Q9NR34 630 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF9Q9P2J2 1179 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTBN4Q9H254 2564 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 NARSO43776 548 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 STBD1O95210 358 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHP08603 1231 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 Q4G0T1 1027 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM186AA6NE01 2351 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 NID2Q14112 1375 aa30.66■■■□□ 2.5
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