RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.58■■□□□ 1.05
SGMS1-208ENST00000608287 WDR64B1ANS9 1081 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MGEA5O60502 916 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TDGQ13569 410 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 DISC1Q9NRI5 854 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 COL1A2P08123 1366 aa21.57■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 FAM205CA6NFA0 338 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SLC37A4O43826 429 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 HBP1O60381 514 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 PSMD10O75832 226 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 RFX1P22670 979 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CA8P35219 290 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 FAM189BP81408 668 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 GUCY1B3Q02153 619 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 HINFPQ9BQA5 517 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF292O60281 2723 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 BTBD18B2RXH4 712 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 FGFR1P11362 822 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SFNP31947 248 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TNFRSF25Q93038 417 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 C8orf76Q96K31 380 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ATP4AP20648 1035 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SDHBP21912 280 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 KLRC1P26715 233 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 JAK3P52333 1124 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM169Q96HH4 297 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 HCSTQ9UBK5 93 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 WDR81Q562E7 1941 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 DMDP11532 3685 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 MARCH6O60337 910 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CASD1Q96PB1 797 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CABP7Q86V35 215 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SIX5Q8N196 739 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 RDM1Q8NG50 284 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 RUBCNQ92622 972 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 BORCS6Q96GS4 357 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 FAM20AQ96MK3 541 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 STK39Q9UEW8 545 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 CDH22Q9UJ99 828 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 IRAK3Q9Y616 596 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-208ENST00000608287 STK25O00506 426 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 NPR3P17342 541 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 UGCGQ16739 394 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 POTEDQ86YR6 584 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 FAM167AQ96KS9 214 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 BACH2Q9BYV9 841 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 WNT16Q9UBV4 365 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 TBX3O15119 743 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 CXCL14O95715 111 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 OATP04181 439 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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