RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 PON1P27169 355 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SOX5P35711 763 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 NT5C1BQ96P26 610 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 TRIM7Q9C029 511 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MTFR1LQ9H019 292 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CYP26A1O43174 497 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CHN1P15882 459 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ATP5DP30049 168 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ERFP50548 548 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 COG2Q14746 738 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ECM1Q16610 540 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 RFFLQ8WZ73 363 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FZD1Q9UP38 647 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ALDH3A1P30838 453 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SLC29A2Q14542 456 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 LONRF1Q17RB8 773 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 LIN9Q5TKA1 542 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 APOL6Q9BWW8 343 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 THAP2Q9H0W7 228 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SPC25Q9HBM1 224 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CHUKO15111 745 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 NDUFB10O96000 172 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SLC20A2Q08357 652 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 STRN3Q13033 797 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KIF22Q14807 665 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PPP2R5EQ16537 467 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PADI6Q6TGC4 694 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SUN1O94901 812 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ISCUQ9H1K1 167 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MYO9BQ13459 2157 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF233A6NK53 670 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 H0Y3Z8 333 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PDXKO00764 312 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FMO5P49326 533 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 AADACL2Q6P093 401 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 LXNQ9BS40 222 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ALG6Q9Y672 507 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PPP4CP60510 307 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 GPC5P78333 572 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MYO1EQ12965 1108 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MTMR2Q13614 643 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 BAP1Q92560 729 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 NUP85Q9BW27 656 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 AGPSO00116 658 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CLDN3O15551 220 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CAND2O75155 1236 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CD58P19256 250 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 LIG4P49917 911 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MFAP3P55082 362 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MYH10P35580 1976 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 HIP1RO75146 1068 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 FAM107AO95990 144 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 RWDD2BP57060 319 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 C18orf8Q96DM3 657 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-216ENST00000608263 CEP170P1Q96L14 293 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms