RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SP4Q02446 784 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNIP1Q15025 636 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGM5Q15124 567 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTMPQ5BVD1 217 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM102BQ5T8I3 360 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCFD2Q8WU76 684 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAVIN3Q969G5 261 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPBP1Q9NZL4 362 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCMT1Q9UIC8 334 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.8□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRIT1O00522 736 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLS3P13797 630 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNNC1P63316 161 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCF2L2Q86YR7 1114 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC127Q96BQ5 260 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COG5Q9UP83 839 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSME4Q14997 1843 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC169A6NNP5 214 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSF2BPO75031 334 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMNB1P20700 586 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF8P28908 595 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAK2Q13177 524 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XKR9Q5GH70 373 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF3Q5VWG9 929 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUBCNQ92622 972 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATG4CQ96DT6 458 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAAL1Q96ER3 474 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PBKQ96KB5 322 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUFY1Q96T51 708 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE4BO95155 1302 aa12.79□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF233A6NK53 670 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD65E5RJM6 399 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTRT1Q8TDG2 376 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACCSQ96QU6 501 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH3GL2Q99962 352 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDCD2LQ9BRP1 358 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGGP02679 453 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADRB2P07550 413 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADSSP30520 456 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCAF12L1Q5VU92 463 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AADACL2Q6P093 401 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POTEAQ6S8J7 498 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQCKQ8N0W5 287 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XXYLT1Q8NBI6 393 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEK9Q8TD19 979 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JDP2Q8WYK2 163 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3R5Q8WYR1 880 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RFFLQ8WZ73 363 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HES6Q96HZ4 224 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEUROG2Q9H2A3 272 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP58Q5T655 872 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF16Q5VV41 709 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPAR1Q92633 364 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM206Q9H813 350 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMFRQ9UKV5 643 aa12.78□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF13BQ9NQT8 1826 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANXA13P27216 316 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ECHS1P30084 290 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLT3P36888 993 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALS2CLQ60I27 953 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANO5Q75V66 913 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGPAT1Q99943 283 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM31Q9BZY9 425 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PXMP2Q9NR77 195 aa12.77□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms