RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-216ENST00000601358 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-216ENST00000601358 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-216ENST00000601358 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-216ENST00000601358 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-216ENST00000601358 ERLIN2O94905 339 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.51■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 PGBD4Q96DM1 585 aa23.5■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 COL19A1Q14993 1142 aa23.49■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.49■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 LINC01565O15544 149 aa23.47■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 PTGDRQ13258 359 aa23.47■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 RAB34Q9BZG1 259 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.47■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 C5orf42Q9H799 3197 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.46■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 CAPSQ13938 189 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.46■■□□□ 1.35
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TIMM50-216ENST00000601358 TCF25Q9BQ70 676 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM50-216ENST00000601358 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.45■■□□□ 1.34
TIMM50-216ENST00000601358 OFD1O75665 1012 aa23.45■■□□□ 1.34
TIMM50-216ENST00000601358 AXLP30530 894 aa23.45■■□□□ 1.34
TIMM50-216ENST00000601358 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
TIMM50-216ENST00000601358 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.45■■□□□ 1.34
TIMM50-216ENST00000601358 TMC7Q7Z402 723 aa23.45■■□□□ 1.34
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