RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596161.5

CCDC61-205, Transcript of coiled-coil domain containing 61, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC61, Length 574 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61-205ENST00000596161 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ADAM2Q99965 735 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TNMDQ9H2S6 317 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 USP25Q9UHP3 1055 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 CCDC169A6NNP5 214 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PLS3P13797 630 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 AXLP30530 894 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SMTNP53814 917 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 AMPD3Q01432 767 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 GIT2Q14161 759 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 DSC3Q14574 896 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FSIP1Q8NA03 581 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RGS18Q9NS28 235 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 DACT1Q9NYF0 836 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 A0A1B0GVL5 298 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MGEA5O60502 916 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NPTX2P47972 431 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MAPK6Q16659 721 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 DDX12PQ92771 950 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PARVGQ9HBI0 331 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 HPSEQ9Y251 543 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MYMKA6NI61 221 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SFI1A8K8P3 1242 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 H0YCG3 227 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 STAG3L1P0CL83 205 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ZNF131P52739 623 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RAB30Q15771 203 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 DYMQ7RTS9 669 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TOP1MTQ969P6 601 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 C9IYK1 514 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TSPAN1O60635 241 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 GJB5O95377 273 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SCP2P22307 547 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SYKP43405 635 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FAM187BQ17R55 369 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MYCT1Q8N699 235 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 CCDC51Q96ER9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FZD8Q9H461 694 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 MSRAQ9UJ68 235 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 K7ERI5 159 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 PRKCBP05771 671 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SLFN14P0C7P3 912 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SKIP12755 728 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 GAP43P17677 238 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RAB27AP51159 221 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NDUFA8P51970 172 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 AMHR2Q16671 573 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 NOTUMQ6P988 496 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 SLC16A4O15374 487 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TLL1O43897 1013 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 UPP2O95045 317 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 LIG1P18858 919 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 ABCD1P33897 745 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC61-205ENST00000596161 RAD9AQ99638 391 aa22.08■■□□□ 1.13
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