RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF20A	O95235	890 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R2	P41236	205 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPC3	P51654	580 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TFDP1	Q14186	410 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	P2RX5	Q93086	422 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7ERI5	159 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNE1	P24864	410 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALCAM	Q13740	583 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	BECN2	A8MW95	431 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YCG3	227 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	B4GALT4	O60513	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTEN	P60484	403 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCAPH	Q15003	741 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR32	O75388	356 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK7	P50613	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFNA5	P52803	228 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYL5	Q02045	173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSE1	Q14687	1217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE4B	O95155	1302 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHKA2	P46019	1235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NME8	Q8N427	588 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSMR	Q99650	979 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TISP43	B9A030	160 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IKBKB	O14920	756 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDN1	P05305	212 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL6A1	P12109	1028 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPK6	Q16659	721 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNN1	Q92952	543 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.06	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDXK	O00764	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTSH	P09668	335 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	THPO	P40225	353 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRN3	Q13033	797 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTK7	Q13308	1070 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCP2	P22307	547 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCD1	P33897	745 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.05	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms