RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BLIDQ8IZY5 108 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP4Q96MN2 994 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 GALTP07902 379 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DZANK1Q9NVP4 752 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IRAK3Q9Y616 596 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT3O60512 393 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 OFD1O75665 1012 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SKIP12755 728 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPER4Q7RTX7 472 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 AIFM3Q96NN9 605 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R3Q9BXE9 311 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 EML1O00423 815 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC37A4O43826 429 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF623O75123 536 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ASGR2P07307 311 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC11A1P49279 550 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC5P62195 406 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RUFY3Q7L099 469 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP3Q9H0R5 595 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DEXIO95424 95 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB27AP51159 221 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GIT2Q14161 759 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 H0Y858 1186 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 NPEPPSP55786 919 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN14Q15678 1187 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 INF2Q27J81 1249 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAT1Q5SQI0 421 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP26B1Q9NR63 512 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMD1Q9UGP4 676 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 VAV3Q9UKW4 847 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 USP34Q70CQ2 3546 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CARNS1A5YM72 827 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ST18O60284 1047 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GFRA3O60609 400 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 REC8O95072 547 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC5Q6UXY8 1006 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM105Q8N8V8 129 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CPLX1O14810 134 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CABP7Q86V35 215 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PGBD4Q96DM1 585 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 DDHD2O94830 711 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 NUBP1P53384 320 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R5CQ13362 524 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LETM2Q2VYF4 491 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT17Q6IS24 598 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 USTQ9Y2C2 406 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 STK3Q13188 491 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 URGCPQ8TCY9 931 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A3Q8WY07 619 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM143Q96AN5 459 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN11Q5T124 520 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP170P1Q96L14 293 aa28.7■■■□□ 2.18
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