RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP45Q9UL16 551 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC3P53804 2025 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01553A4QN01 128 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC169A6NNP5 214 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 C9IYK1 514 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 HIP1RO75146 1068 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DGKIO75912 1065 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCG1P19174 1290 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DDIT3P35638 169 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GATMP50440 423 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC12A3P55017 1021 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 POU5F1BQ06416 359 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ARSHQ5FYA8 562 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRED2Q7Z698 418 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FIBCD1Q8N539 461 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC15Q8TF66 581 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MYLIPQ8WY64 445 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 BSNDQ8WZ55 320 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT74Q96LB3 600 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CHST12Q9NRB3 414 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ERI5 159 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC26A4O43511 780 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CUTAO60888 179 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP6R2O75170 966 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ERLIN2O94905 339 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 YEATS4O95619 227 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FGFR1P11362 822 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 IGFBP4P22692 258 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TXLNAP40222 546 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ME1P48163 572 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX3P56589 373 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ATL3Q6DD88 541 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GPBP1Q86WP2 473 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DAW1Q8N136 415 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PDILTQ8N807 584 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DEPTORQ8TB45 409 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD54LQ92698 747 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KIFAP3Q92845 792 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 LPPQ93052 612 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GUCD1Q96NT3 240 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DACT1Q9NYF0 836 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 USP20Q9Y2K6 914 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087X0B3 334 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0U1RQF3 1178 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC16A4O15374 487 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 B4GALT5O43286 388 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN1O60635 241 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EOMESO95936 686 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GUCY2CP25092 1073 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AXLP30530 894 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NAMPTP43490 491 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NPTX2P47972 431 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVK-21P61565 698 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT85P78386 507 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK7Q13164 816 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms