RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 MARCH6O60337 910 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 RNF135Q8IUD6 432 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SUSD6Q92537 303 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 FAM122AQ96E09 287 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 DYDC2Q96IM9 177 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 RGL1Q9NZL6 768 aa20.44■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CARNS1A5YM72 827 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 BCAR1P56945 870 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TMC7Q7Z402 723 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 LPPQ93052 612 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TMEM143Q96AN5 459 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 S1PR5Q9H228 398 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ASAP2O43150 1006 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SLITRK3O94933 977 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 LYPLA2O95372 231 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 EMC2Q15006 297 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TCP11Q8WWU5 503 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 BTBD18B2RXH4 712 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 OFD1O75665 1012 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 NEK4P51957 841 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CYP4A11Q02928 519 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 XKR9Q5GH70 373 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 FERMT3Q86UX7 667 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PGBD4Q96DM1 585 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB39O15060 712 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 JAK2O60674 1132 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TECP42680 631 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 ST3GAL1Q11201 340 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CALCRLQ16602 461 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TPH2Q8IWU9 490 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TMEM169Q96HH4 297 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 MTRQ99707 1265 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 IRAK3Q9Y616 596 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 TECTAO75443 2155 aa20.39■□□□□ 0.86
CTIF-206ENST00000588345 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 WNT7AO00755 349 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 GALTP07902 379 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 LONRF3Q496Y0 759 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 UBXN11Q5T124 520 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 RNF149Q8NC42 400 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 EDAQ92838 391 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 CASP10Q92851 521 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 IGSF21Q96ID5 467 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 MTMR9Q96QG7 549 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 ZBP1Q9H171 429 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.39■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 NEMFO60524 1076 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 POU5F1BQ06416 359 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-206ENST00000588345 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms