RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM253P0C7T8 217 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCND2P30279 289 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNA2P51530 1060 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALCP54803 685 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DLG4P78352 724 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPC2Q52LR7 807 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFT20Q8IY31 132 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WNK4Q96J92 1243 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP20Q9Y2K6 914 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RIPK3Q9Y572 518 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC66A2RUB6 948 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGPSO00116 658 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNK3O14649 394 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEX3P56589 373 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP3CAQ08209 521 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NNTQ13423 1086 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1orf220Q5T0J3 134 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HVCN1Q96D96 273 aa17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM150BA6NC51 233 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRAP18433 802 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNNC1P63316 161 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XKR9Q5GH70 373 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRX1Q86UT6 975 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFFLQ8WZ73 363 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOC7Q9UPT5 735 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCTP09848 1927 aa17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERICH4A6NGS2 130 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC16A4O15374 487 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF40O75150 1001 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLSTN1O94985 981 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB7AO95365 584 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLI1P08151 1106 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NR3C2P08235 984 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DSG3P32926 999 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP44Q17R89 818 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANO5Q75V66 913 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEX26Q7Z412 305 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NT5DC3Q86UY8 548 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCFD2Q8WU76 684 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT12Q99456 494 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HINFPQ9BQA5 517 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA6BA6NDN3 693 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C19orf81C9J6K1 198 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNFAIP3P21580 790 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GGCXP38435 758 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASGEF1CQ8N431 466 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HES6Q96HZ4 224 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WRNIP1Q96S55 665 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAF1Q9H063 256 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf75Q9HAS0 396 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PICK1Q9NRD5 415 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR90Q96KV7 1748 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP2A1O14983 1001 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHACTR2O75167 634 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMTNP53814 917 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPATQ06203 517 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAAM2Q86T65 1068 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP4K3Q8IVH8 894 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 METTL13Q8N6R0 699 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHO2Q8TD55 490 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBX20Q9UMR3 447 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD62A6NC57 917 aa17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNA2P16389 499 aa17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCLMP48507 274 aa17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms