RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 MTMR6Q9Y217 621 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.5■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 STX6O43752 255 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 FGFR1P11362 822 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PTPROQ16827 1216 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 NCOR1O75376 2440 aa15.49■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PTPAQ15257 358 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 AMHR2Q16671 573 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PPM1EQ8WY54 764 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 KIFAP3Q92845 792 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CCDC51Q96ER9 411 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PNMA5Q96PV4 448 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CWH43Q9H720 699 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 AAASQ9NRG9 546 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 E9PMD0 336 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 TSPAN1O60635 241 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 ERLIN2O94905 339 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PPP2R5AQ15172 486 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 FAM187BQ17R55 369 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 UBXN11Q5T124 520 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 KCNK18Q7Z418 384 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 ABI1Q8IZP0 508 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CNNM3Q8NE01 707 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PGBD4Q96DM1 585 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 FZD8Q9H461 694 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.47■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 GRM6O15303 877 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 NAMPTP43490 491 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 NOTUMQ6P988 496 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 LRRC43Q8N309 656 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 BSNDQ8WZ55 320 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 TIPINQ9BVW5 301 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CSRNP2Q9H175 543 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 COG5Q9UP83 839 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 CLIC4Q9Y696 253 aa15.46■□□□□ 0.07
GGA3-215ENST00000582821 MYH11P35749 1972 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 A0A1B0GUA9 196 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 OFD1O75665 1012 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 ITGB1P05556 798 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 LAG3P18627 525 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 UBA7P41226 1012 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 UBE3AQ05086 875 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 CAMK1Q14012 370 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 CABP7Q86V35 215 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 RNF169Q8NCN4 708 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 HELQQ8TDG4 1101 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 IFT74Q96LB3 600 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 KCND2Q9NZV8 630 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 THEGQ9P2T0 379 aa15.45■□□□□ 0.06
GGA3-215ENST00000582821 TTC28Q96AY4 2481 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms