RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580103.6

NSRP1-208, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-208	ENST00000580103	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	INF2	Q27J81	1249 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	HAS1	Q92839	578 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	LPP	Q93052	612 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ZBP1	Q9H171	429 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ZNF292	O60281	2723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DTNB	O60941	627 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	OFD1	O75665	1012 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	GALT	P07902	379 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TIE1	P35590	1138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	MRE11	P49959	708 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NPEPPS	P55786	919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PSMC5	P62195	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	KRT17	Q04695	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SCRN1	Q12765	414 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	LILRB3	O75022	631 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TCF15	Q12870	199 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	STK3	Q13188	491 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CASP10	Q92851	521 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	IGSF21	Q96ID5	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	POMK	Q9H5K3	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CPLX1	O14810	134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ZBTB39	O15060	712 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	TBX3	O15119	743 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PFKFB2	O60825	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DDHD2	O94830	711 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CXCL14	O95715	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	EFEMP2	O95967	443 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	CTSA	P10619	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SLC11A1	P49279	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DNM2	P50570	870 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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