RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577667.1

PPP4R1-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 1, human

TSL 4

Gene PPP4R1, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R1-205	ENST00000577667	DSG1	Q02413	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667		Q6ZRM9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CD40	P25942	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SCNN1G	P51170	649 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TGFB2	P61812	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	APPBP2	Q92624	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NINJ1	Q92982	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CHD1	O14646	1710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ADH4	P08319	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	LRRC32	Q14392	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MTSS1	O43312	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FSBP	O95073	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PCDH8	O95206	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAK	P20794	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TGM1	P22735	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TGM5	O43548	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CDC45	O75419	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	GAA	P10253	952 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	NPEPPS	P55786	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SPIDR	Q14159	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPP4R1-205	ENST00000577667	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPP4R1-205	ENST00000577667	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPP4R1-205	ENST00000577667	PEX11B	O96011	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPP4R1-205	ENST00000577667	SCNN1B	P51168	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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