RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	STAT2	P52630	851 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	SP8	Q8IXZ3	490 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	FMO2	Q99518	471 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	APBA3	O96018	575 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PRLR	P16471	622 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	COMT	P21964	271 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CAVIN3	Q969G5	261 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CLDN3	O15551	220 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ICE2	Q659A1	982 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	KAZN	Q674X7	775 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PADI6	Q6TGC4	694 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ISCU	Q9H1K1	167 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	EPN3	Q9H201	632 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	SWAP70	Q9UH65	585 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PYGM	P11217	842 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM212A	Q96EL1	285 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PDXK	O00764	312 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	POLR2M	P0CAP2	368 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ERF	P50548	548 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	MYH1	P12882	1939 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	MYH4	Q9Y623	1939 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	EYA4	O95677	639 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF394	Q53GI3	561 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TTC27	Q6P3X3	843 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	SCFD2	Q8WU76	684 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	COL20A1	Q9P218	1284 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CHN1	P15882	459 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PPAT	Q06203	517 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	UGCG	Q16739	394 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TCP11	Q8WWU5	503 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TATDN2	Q93075	761 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP1R7	Q15435	360 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		15.99	■□□□□ 0.15
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PRPF8-216	ENST00000577001	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
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PRPF8-216	ENST00000577001	DNM1L	O00429	736 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ATP9A	O75110	1047 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ITGB5	P18084	799 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	XKR9	Q5GH70	373 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	LDHD	Q86WU2	507 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	JAML	Q86YT9	394 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF653	Q96CK0	615 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	RPS6KA5	O75582	802 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CLTA	P09496	248 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	DAW1	Q8N136	415 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	WHAMM	Q8TF30	809 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	BICD1	Q96G01	975 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRPF8-216	ENST00000577001	GMNC	A6NCL1	334 aa		15.97	■□□□□ 0.15

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