RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 VPS36Q86VN1 386 aa20.39■□□□□ 0.86
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SPNS3-204ENST00000575194 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 C17orf99Q6UX52 265 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS3-204ENST00000575194 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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