RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	24.25	■■□□□ 1.47	2e-6	■■□□□ 13.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL2	P36404	184 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	24.25	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	24.25	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB27A	P51159	221 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PTEN	P60484	403 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCB3	Q01970	1234 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	POU5F1B	Q06416	359 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDND1	Q9NY35	253 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	24.24	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	SKI	P12755	728 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	RPA1	P27694	616 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LPP	Q93052	612 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LZTS1	Q9Y250	596 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRA2	P23416	452 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PBX3	P40426	434 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPS	Q13938	189 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	24.22	■■□□□ 1.47	3e-14	■■■■□ 21.8
PPP4C-205	ENST00000563200	UBXN11	Q5T124	520 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	NACC1	Q96RE7	527 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR9	Q9NR96	1032 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF3A	Q9Y496	699 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	FSCN2	O14926	492 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM2	P49736	904 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVFC1	P60507	584 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM15	Q13444	863 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF558	Q96NG5	402 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01565	O15544	149 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX10	O75333	385 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IL9	P15248	144 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGDR	Q13258	359 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TFDP1	Q14186	410 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEG	Q6S5H5	508 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ERMN	Q8TAM6	284 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFLR1	Q9H665	355 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN1	O60635	241 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	OFD1	O75665	1012 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MUT	P22033	750 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GJB2	P29033	226 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1A	P35813	382 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PDIA5	Q14554	519 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ECM1	Q16610	540 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	AMHR2	Q16671	573 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	LONRF3	Q496Y0	759 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EFHB	Q8N7U6	833 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SPG21	Q9NZD8	308 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NRIP1	P48552	1158 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PGBD4	Q96DM1	585 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CD320	Q9NPF0	282 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC1B	Q9P126	229 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	LAD1	O00515	517 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ERLIN2	O94905	339 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GLP2R	O95838	553 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	AXL	P30530	894 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAR1	P56945	870 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17A	Q16552	155 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46

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