RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 XKR9Q5GH70 373 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEGQ6S5H5 508 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF135Q8IUD6 432 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP7D2Q96T17 732 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 OSMRQ99650 979 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TLE6Q9H808 572 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 C9IYK1 514 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 RARRES1P49788 294 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TLR9Q9NR96 1032 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXA2O43364 376 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MGEA5O60502 916 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC25AP30304 524 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 RFC5P40937 340 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM228AQ86W67 206 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 CLEC1BQ9P126 229 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 LAG3P18627 525 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 GATMP50440 423 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM189BP81408 668 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 EMC2Q15006 297 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPAQ15257 358 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 KSR1Q8IVT5 923 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ERMNQ8TAM6 284 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 EDAQ92838 391 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM143Q96AN5 459 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 LZTS1Q9Y250 596 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 FGF18O76093 207 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MUTP22033 750 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 NACC1Q96RE7 527 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 CLIC4Q9Y696 253 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 C5orf42Q9H799 3197 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 DNM2P50570 870 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIN1Q05586 938 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PKP1Q13835 747 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.27■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A087WZ62 844 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DGAT1O75907 488 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DSC3Q14574 896 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RAB34Q9BZG1 259 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-210ENST00000559586 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.26■■□□□ 1.15
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