RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMPD3Q5JV73 1810 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 H0YCG3 227 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CETN3O15182 167 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TGFB1I1O43294 461 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CABYRO75952 493 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPM2P07951 284 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAMPTP43490 491 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETD4Q9NVD3 440 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBX20Q9UMR3 447 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.92■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 C22orf31O95567 290 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLCN3P51790 818 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 HVCN1Q96D96 273 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP63Q96MT8 703 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEFB118Q96PH6 123 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KBTBD13C9JR72 458 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 N4BP3O15049 544 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR3C1P04150 777 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAT1P11488 350 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMOD1P28289 359 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC25BP30305 580 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF333Q96JL9 665 aa18.91■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPFP49454 3210 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCD1P33897 745 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACLYP53396 1101 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPSQ13938 189 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP135Q66GS9 1140 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMC5Q96C12 935 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVPLQ92817 2033 aa18.9■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GTH6 734 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 K7ERI5 159 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNA14O95837 355 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRN3Q13033 797 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR1I3Q14994 352 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 BICD1Q96G01 975 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.89■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP2J2P51589 502 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TFDP1Q14186 410 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMC6Q7Z403 805 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF149Q8NC42 400 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLRP4Q96MN2 994 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKT3Q9Y243 479 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASAP2O43150 1006 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX33O43247 280 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 GJB1P08034 283 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPN21Q16825 1174 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP7D2Q96T17 732 aa18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 TISP43B9A030 160 aa18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNM1LO00429 736 aa18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCP2P22307 547 aa18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFIL3Q16649 462 aa18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.87■□□□□ 0.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms