RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 FGF18O76093 207 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 GJB2P29033 226 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 IRS1P35568 1242 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 RAB27AP51159 221 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 UBE3AQ05086 875 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 HYAL1Q12794 435 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 LPPQ93052 612 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 H3BQV1 296 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 ERLIN2O94905 339 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 POTEGQ6S5H5 508 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF558Q96NG5 402 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 NACC1Q96RE7 527 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 TLR9Q9NR96 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 ARL2P36404 184 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PBX3P40426 434 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PTENP60484 403 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 COL19A1Q14993 1142 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PGBD4Q96DM1 585 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD1-208ENST00000555806 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 GLRA2P23416 452 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RPA1P27694 616 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PPM1AP35813 382 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PTGDRQ13258 359 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 CAPSQ13938 189 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RAB34Q9BZG1 259 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF623O75123 536 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 SPG21Q9NZD8 308 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LINC01565O15544 149 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 TSPAN1O60635 241 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 IL9P15248 144 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 NRIP1P48552 1158 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 NDUFV1P49821 464 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PLCB3Q01970 1234 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 KRT17Q04695 432 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 POU5F1BQ06416 359 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 CLUL1Q15846 466 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 NOTUMQ6P988 496 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 CPB2Q96IY4 423 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 TLE6Q9H808 572 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 FAM50BQ9Y247 325 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LZTS1Q9Y250 596 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LAD1O00515 517 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 MUTP22033 750 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 AXLP30530 894 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 LTBRP36941 435 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 BCAR1P56945 870 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 ERVFC1P60507 584 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 UBXN11Q5T124 520 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD1-208ENST00000555806 PADI6Q6TGC4 694 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms