RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM3C	Q92520	227 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	EXTL3	O43909	919 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	DSC3	Q14574	896 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	USH1G	Q495M9	461 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PHKB	Q93100	1093 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NMT2	O60551	498 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MAPK8	P45983	427 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGBP1	P78318	339 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TEX28	O15482	410 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MARK3	P27448	753 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	LY6D	Q14210	128 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IER5	Q5VY09	327 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ARID3A	Q99856	593 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	EVPL	Q92817	2033 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH6	P13533	1939 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617		B4E1Z4	1266 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CFB	P00751	764 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GRM2	Q14416	872 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GLUD1	P00367	558 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CCNE1	P24864	410 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SP4	Q02446	784 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GALT	P07902	379 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ADD2	P35612	726 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	F8	P00451	2351 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ABCD4-222	ENST00000555617	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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