RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 TUBP50607 506 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PHC1P78364 1004 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TLE2Q04725 743 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FOXO1Q12778 655 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SCARB2Q14108 478 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PFKFB4Q16877 469 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PARP10Q53GL7 1025 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ODF2Q5BJF6 829 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DCAF15Q66K64 600 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KCNT2Q6UVM3 1135 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 WAPLQ7Z5K2 1190 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TTC30AQ86WT1 665 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PRR18Q8N4B5 295 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TSPYL6Q8N831 410 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GALNT11Q8NCW6 608 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PANK1Q8TE04 598 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DCAF11Q8TEB1 546 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 C7orf26Q96N11 449 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ACAP3Q96P50 834 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PREBQ9HCU5 417 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CEP72Q9P209 647 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KNSTRNQ9Y448 316 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 USP19O94966 1318 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TISP43B9A030 160 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 B9A039 149 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 H7C1D1 291 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NDUFS2O75306 463 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 B3GALNT1O75752 331 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FSBPO95073 299 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KRT1P04264 644 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SCG5P05408 212 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CKMP06732 381 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 C8AP07357 584 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CTSBP07858 339 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SSTR4P31391 388 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MC4RP32245 332 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 IL12RB1P42701 662 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ITGA8P53708 1063 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SLC16A1P53985 500 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GPR85P60893 370 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RAC1P63000 192 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ID3Q02535 119 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PAK1Q13153 545 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MAPK7Q13164 816 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CUL4AQ13619 759 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SLMAPQ14BN4 828 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SNX17Q15036 470 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MPEG1Q2M385 716 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FBLN7Q53RD9 439 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PPM1JQ5JR12 505 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 METTL24Q5JXM2 366 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms